Nemo — файловый менеджер по умолчанию для Cinnamon и в оригинале ему нужен установленный Cinnamon для установки и работы, даже если вы хотите использовать его в окружении рабочего стола типа Unity или Gnome Shell. Nemo в PPA WebUpd8 использует ряд патчей для обеспечении работы Nemo непосредственно в Unity, без соблюдения зависимостей Cinnamon (единственная зависимость - Cinnamon Translations). Решение так же должно работать для других рабочих столов, но некоторые патчи добавлены исключительно под функционал Unity, соответственно и тестировалось всё это только на Unity.