Если ваш сайт доступен по адресу site.com и www.site.com, то это может вызвать путаницу в сборе статистики, да и поисковики воспринимают это как два разных сайта. На этих адресах действительно может быть два разных сайта. На серверах Apache эту проблему решает mod_rewrite. Редактируем файл .htaccess.