Опция построения меню и изменения ассоциации файлов в Wine задумывалась из благих побуждений. По крайней мере на это хочется надеяться. Видимо, кто-то сильно верил, что в будущем с помощью Wine можно будет запустить абсолютно всё и заранее приготовил «интеграцию».